O anime ocorre no ano de 2031 quando surgem misteriosamente criaturas chamadas de Hardian. Mais tarde depois que eles se multiplicaram, repentinamente começaram a atacar as pessoas. Para pesquisar e combater os Hardians, foi fundada N.I.D.F, e o piloto Aiba Syuu e a sua equipe são envolvidos nesta guerra contra a nova raça.
