A história original gira em torno de Haruka Nanase, um menino que sempre gostou de nadar. Após perder ao ser desafiado por um antigo colega de equipe, Rin Matsuoka, ele se reúne com Makoto, Nagisa, antigos colegas de clube, e Rei Ryugazaki para criarem o Iwatobi High School Swimming Club, onde o maior foco de Haruka é derrotar Rin.
